«Почему я?..» - последнее о чём подумала молодая проститутка Рун Балот. Её человеческая жизнь оборвалась, рабыня опасного картёжника Шела погибла от его же руки. На этом её история бы и закончилась, если бы не одно но - девушка стала киборгом. Получив силу, она желает расквитаться с Шелом и его помощником Бойледом..

В недалеком 2029 году сети и компьютеры развились до того, что появилась возможность создавать высокотехнологичных киборгов с полной интеграцией в Сеть. Главная героиня Кусанаги Мотоко — киборг, с человеческим разумом внутри кибернетического тела, майор Девятого отдела, созданного для спецопераций правительства. В Сети объявляется некий Кукловод, манипулирующий людьми через ту же Сеть, заставляя их действовать в его интересах. Его поимкой и занимается Девятый отдел. Но не все так просто,